根据《中华人民共和国海关<海峡两岸经济合作框架协议>项下进出口货物原产地管理办法》（海关总署令第200号）第三条　“从台湾直接运输进口的货物，符合下列条件之一的，其原产地为台湾，适用《中华人民共和国进出口税则》（以下简称《税则》）中的《协议》协定税率”，因此企业申请适用ECFA协定税率的货物应当持有特定格式原产地证书，相关货物必须由台湾直接运输至中国大陆，上海汇业外贸律师专家详细介绍一下。

如果企业从第三方进口台湾原产货物（货物由第三方运输至大陆），尽管其持有ECFA原产地证书，但不符合“直接运输”的条件，不能适用协定税率。

如果企业与第三方进行贸易，相关货物由台湾直接运输至大陆，这种情况下的“第三方贸易”不影响协定税率的适用。